助力Omicron研究,InvivoGen推出变异株质粒

助力Omicron研究,InvivoGen推出变异株质粒

Omicron(奥密克戎新冠变异毒株(Clade 21K/ B.1.1.529(BA.1))来势汹汹,比其他令人担忧的变异株具有更高的再次感染风险。这个变体存在大量突变,其中一些是令人担忧的。为此,InvivoGen推出了Omicron(奥密克戎变异株假型质粒和Omicron(奥密克戎变异株表达质粒,这些质粒编码了Omicron(奥密克戎变异株的Spike全长序列


SARS-CoV-2 Spike假型质粒-Omicron变异株

InvivoGen提供一系列编码了各种Spike变异株的pLV-Spike质粒,可与包装质粒和GFP报告质粒共转染293T细胞,这些质粒可以生成Spike假型慢病毒颗粒。假型慢病毒颗粒感染了表达SARS-CoV-2宿主受体的易感细胞系(例如A549-hACE2-TMPRSS2或HEK-Blue™ hACE2-TMPRSS2细胞)后,可以通过GFP表达量进行测定。此方法适合于病毒进入研究,并可用于测试抗体和小分子抑制剂的中和潜力。


其中,pLV-SpikeV11编码了Omicron(奥密克戎)变异株(Clade 21K/ B.1.1.529(BA.1))的Spike全长序列。为了获得最佳的表达效果。InvivoGen对密码子进行了优化并去除了Cterminal ER-retention signal,该质粒可与报告质粒和辅助蛋白质粒共转染后产生Spike假型慢病毒颗粒,也可用于SARS-CoV-2抑制剂的筛选。  


质粒特征

序列参考: EPI_ISL_6699761.1

密码子优化

ORF大小: 3756 bp

测序引物:
– Forward rbt β-globin intron: TGGTTACAATGATATACACTG
– Reverse rbt β-globin pAn: CTCAAGGGGCTTCATGATGTC


质量控制:
– 质粒通过限制性内切酶分析和全长开放阅读框 (ORF) 的测序来确认
– 离子交换色谱纯化后,电泳确认超螺旋构象

 

SARS-CoV-2 Spike表达质粒-Omicron变异株

pUNO1-SpikeV1和pUNO1-SpikeV11-dfur是专为在哺乳动物细胞中表达SARS-CoV-2 Spike (S)蛋白而设计的质粒,包含含有功能性furin裂解位点或无活性的furin裂解位点两种形式。为了获得最佳的表达效果。InvivoGen对这两个质粒的密码子进行了优化并去除了Cterminal ER-retention signal,可用于SARS-CoV-2抑制剂的筛选,包括小分子、单克隆抗体、康复期血浆。pUNO1-SpikeV11含有功能性furin裂解位点,推荐用于Spike/ACE2细胞融合实验;pUNO1-SpikeV11-dfur含有无活性的furin裂解位点,推荐用于流式细胞术检测细胞表面。

质粒特征

货号

pUNO1-SpikeV11

pUNO1-SpikeV11-dfur

序列参考

EPI_ISL_6841980

EPI_ISL_6841980

密码子优化

密码子优化和R683/5A突变

ORF大小

3756 bp

3756 bp

测序引物

– Forward HTLV 5’UTR: TGCTTGCTCAACTCTACGTC
– Reverse SV40 pAn: AACTTGTTTATTGCAGCTT

– Forward HTLV 5’UTR: TGCTTGCTCAACTCTACGTC
– Reverse SV40 pAn: AACTTGTTTATTGCAGCTT

质量控制

-质粒通过限制性内切酶分析和全长开放阅读框 (ORF) 的测序来确认

-离子交换色谱纯化后,电泳确认超螺旋构象

 

相关产品信息

货号

名称

规格

plv-spike-v11

pLV-SpikeV11

20 µg

p1-spike-v11

pUNO1-SpikeV11

20 µg

p1-spike-v11-df

pUNO1-SpikeV11-dfur

20 µg

 

 

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用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

2021 年 11 月 26 日,WHO 将 SARS-CoV-2 变体 B.1.1.529 指定为第五种关注变体 (VOC),并将其命名为“Omicron”,在其基因组中的 50 多个突变中,至少有 32 个位于棘突蛋白,其中 RBD 有 15 个点突变(图 1);与其他 VOC 一样,在 Omicron 的核蛋白中也发现了突变(图 2);Omicron 分布广泛,胜过 Delta,尽管它似乎会导致更轻微的疾病,但它仍然导致住院人数增加。 

用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

图 1. Spike mutation sites found in Omicron are A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F.

用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

图 2. Nucleocapsid protein mutation sites found in Omicron are P13L, Δ31-33, R203M, G204R, and in Delta are D63G, R203M, G215C, D377Y.

GeneTex 提供一系列用于Omicron 研究的重组抗体和蛋白质试剂,值得注意的是,其免疫原不包含任何 Omicron 突变位点的棘蛋白和核蛋白抗体如图 2 所示。请参阅下面的精选产品列表以及表格所选抗体对VOC的反应性。

精选产品


用于Omicron研究的抗体和重组蛋白


用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD Protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag (GTX136716-pro)


用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

SARS-CoV-2 (COVID-19) nucleocapsid protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag (GTX136779-pro)


用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike (ECD) Protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag (GTX136780-pro)


用于Omicron研究的抗体和重组蛋白

SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD antibody [HL257] (GTX635692)

 

SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD antibody [HL1014] (GTX635807)



表一  侧流分析 (建议的核蛋白兔重组抗体对)

抗体对

产品名

EC50

目录号

Pair I Nucleocapsid antibody [HL5511] 14 pM GTX635689
Pair I Nucleocapsid antibody [HL448] 11 pM GTX635686
Pair II Nucleocapsid antibody [HL5410] 9 pM GTX635685
Pair II Nucleocapsid antibody [HL455] 6 pM GTX635688


表二  Omicron Spike RBD 和棘蛋白和核蛋白重组蛋白

产品名

表现系统

目录号

Spike (ECD) Protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag HEK293 GTX136780-pro
Spike RBD Protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag HEK293 GTX136716-pro
SARS-CoV-2 (COVID-19) nucleocapsid protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag HEK293 cells GTX136779-pro

表三  GeneTex Spike抗体克隆检测到的
SARS-CoV-2 VOCs

产品名

目录号

WIV04/2019
(reference
sequence)

B.1.617.2
(Delta)

B.1.1.529
(Omicron)

Spike RBD antibody [HL1014] GTX635807
Spike RBD antibody [HL1002] GTX635791 X
Spike RBD antibody [HL1003] GTX635792
Spike RBD antibody [HL1004] GTX635793
Spike S1 antibody [HL13402] GTX635713 X
Spike S1 antibody [GT263] GTX635708 X 未检测 X
Spike antibody [1A9] GTX632604
Spike S2 antibody [HL237] GTX635693

使用指定的 GeneTex 单克隆抗体,通过间接 ELISA 检测源自不同 SARS-CoV-2 变体的重组棘蛋白(三聚体)。
● 强检测。当使用 1μg/ml 蛋白质时,定义为 OD450 值 >1。
○ 弱检测。当使用 4μg/ml 蛋白质时,定义为 OD450 值 >1。
X 未检出。当使用 4μg/ml 蛋白质时,定义为 OD450 值<1。

详情请咨询Genetex代理商上海金畔生物科技有限公司

ViroStat新品推荐—Omicron Reactive Covid-19 Antibodies

ViroStat新品推荐—Omicron Reactive Covid-19 Antibodies

新冠病毒变异株奥密克戎(Omicron)变异体在spike蛋白中有多个突变。然而,研究者发现变异株奥密克戎(Omicron)变异体在核衣壳蛋白(nucleocapsid protein )中也有突变。目前有的抗原检测是通过免疫方法来检测核衣壳蛋白的。那么个检测方法中使用的抗体必须识别突变的核衣壳抗原,否则将导致假阴性试验。


ViroStat已经验证了他们的4个小鼠单克隆抗体(产品#3865-#3868)对与奥密克戎(Omicron)变异体突变的核衣壳蛋白的反应性。这些高亲和力抗体能成功地用于 lateral flow 和ELISA应用中,也用于其它突变体的抗原检测。


订购详情:

货号

亚型

规格

应用

3865

IgG1

1ml

Suggested starting ranges are 1:10-1:50 for IFA and 1:20-1:200 for ELISA

3866

IgG1

1ml

3867

IgG2b

1ml

3868

IgG1

1ml

 

 


详情请咨询 ViroStat 中国代理- 上海金畔生物