什么是表观遗传学?

什么是表观遗传学?

你的基因对你的健康起着重要作用,但你的行为和环境也起着重要作用,比如你吃什么,你的身体活动程度如何。表观遗传学是研究你的行为和环境如何导致影响基因工作方式的变化的学科。与遗传变化不同,表观遗传变化是可逆的,不会改变你的DNA序列,但它们可以改变你的身体读取DNA序列的方式。

基因表达是指根据基因中的指令产生蛋白质的频率或时间。虽然基因变化可以改变蛋白质的组成,但表观遗传变化会影响基因表达,从而“打开”和“关闭”基因。由于饮食和运动等环境和行为会导致表观遗传变化,因此很容易看出基因与行为和环境之间的联系。

表观遗传学是如何工作的?

表观遗传变化以不同方式影响基因表达。表观遗传变化的类型包括:

DNA甲基化

DNA甲基化通过向DNA中添加一个化学基团来起作用。通常,这一组被添加到DNA上的特定位置,在那里它阻止附着在DNA上的蛋白质“读取”基因。这种化学基团可以通过称为去甲基化的过程去除。通常,甲基化使基因“关闭”,去甲基化使基因“开启”

组蛋白修饰

DNA包裹着称为组蛋白的蛋白质。紧密包裹在组蛋白周围的DNA不能被“读取”基因的蛋白质访问。一些基因包裹在组蛋白周围并“关闭”,而一些基因没有包裹在组蛋白周围并“打开”。可以从组蛋白中添加或删除化学基团,并改变基因是否被打开或包裹(“打开”或“关闭”)。

非编码RNA

你的DNA被用作制造编码和非编码RNA的指令。编码RNA用于制造蛋白质。非编码RNA通过与编码RNA和某些蛋白质结合,分解编码RNA,使其不能用于制造蛋白质,从而帮助控制基因表达。非编码RNA也可能招募蛋白质来修饰组蛋白,从而“打开”或“关闭”基因。

你的表观遗传学如何改变?

你的表观遗传学随着年龄的增长而变化,这既是正常发育和衰老的一部分,也是对你的行为和环境的反应。

表观遗传学与发育

表观遗传变化在你出生之前就开始了。你所有的细胞都有相同的基因,但外观和行为却不同。随着你的生长发育,表观遗传学有助于确定一个细胞将具有哪些功能,例如,它将成为心脏细胞、神经细胞还是皮肤细胞。

示例:神经细胞与肌肉细胞

你的肌肉细胞和神经细胞有相同的DNA,但工作方式不同。神经细胞将信息传输到身体的其他细胞。肌肉细胞的结构有助于提高身体的运动能力。表观遗传学允许肌肉细胞“打开”基因,使蛋白质对其工作重要,并“关闭”对神经细胞工作重要的基因。

表观遗传学与年龄

你的表观遗传学在你的一生中都会发生变化。出生时的表观遗传学与童年或成年时的表观遗传学不同。

例:新生儿与26岁与103岁的对比研究

对一名新生儿、26岁和103岁的婴儿进行了数百万个位点的DNA甲基化检测。DNA甲基化水平随着年龄的增长而降低。新生儿的DNA甲基化水平最高,103岁的DNA甲基化水平最低,26岁的DNA甲基化水平介于新生儿和103岁之间(1)。

表观遗传学与可逆性

并非所有的表观遗传变化都是永久性的。一些表观遗传变化可以根据行为或环境的变化而添加或删除。

例:吸烟者与非吸烟者与前吸烟者

吸烟会导致表观遗传变化。例如,在AHRR基因的某些部分,吸烟者的DNA甲基化程度往往低于不吸烟者。重度吸烟者和长期吸烟者之间的差异更大。戒烟后,前吸烟者可能开始增加该基因的DNA甲基化。最终,他们可以达到与不吸烟者相似的水平。在某些情况下,这种情况可能在一年内发生,但时间长短取决于戒烟前吸烟的时间和数量。

表观遗传学与健康

表观遗传变化会以不同方式影响您的健康:

传染

细菌可以改变你的表观遗传学,削弱你的免疫系统。这有助于细菌存活。

例:结核分枝杆菌

结核分枝杆菌引起肺结核。感染这些细菌会导致某些免疫细胞中的组蛋白发生变化,从而导致“关闭”IL-12B基因。关闭IL-12B基因会削弱你的免疫系统,提高结核分枝杆菌的存活率(3)。

巨蟹座

某些突变使你更容易患癌症。类似地,某些表观遗传变化会增加患癌症的风险。例如,BRCA1基因突变使其无法正常工作,这使你更有可能患乳腺癌和其他癌症。类似地,导致BRCA1基因表达降低的DNA甲基化增加了患乳腺癌和其他癌症的风险(4)。虽然癌细胞增加了某些基因的DNA甲基化,但与正常细胞相比,癌细胞的总体DNA甲基化水平较低。看起来相似的不同类型的癌症可能有不同的DNA甲基化模式。表观遗传学可用于帮助确定一个人患有哪种类型的癌症,或有助于尽早发现难以发现的癌症。单靠表观遗传学无法诊断癌症,癌症需要通过进一步的筛查测试来确认。

例:结直肠癌

结直肠癌增加了SEPT9基因的甲基化。一些商业的基于表观遗传学的结直肠癌检测着眼于SEPT9基因的DNA甲基化水平。当与其他诊断筛查测试一起使用时,这些基于表观遗传学的测试可以帮助早期发现癌症(5)(6)。

孕期营养

孕妇怀孕期间的环境和行为,如是否食用健康食品,会改变婴儿的表观遗传学。其中一些变化可能会持续几十年,并可能使儿童更容易患某些疾病。

例如:荷兰饥饿冬季饥荒(1944-1945)

母亲在饥荒期间怀孕的人更容易患上某些疾病,如心脏病、精神分裂症和2型糖尿病(7)。饥荒发生大约60年后,研究人员观察了母亲在饥荒期间怀孕的人的甲基化水平。与出生前没有遭受饥荒的兄弟姐妹相比,这些人在某些基因上的甲基化增加,而在其他基因上的甲基化减少(8)(9)(10)。甲基化的这些差异有助于解释为什么这些人在晚年患某些疾病的可能性增加(7)(10)(11)(12)。

相关文献:

1.Heyn H, Li N, Ferreira H, et al., Distinct DNA methylomes of newborns and centenariansexternal icon. Proc Natl Acad Sci U S A 2012; 109:10522-7

2.McCartney D, Stevenson A, Hillary R, et al., Epigenetic signatures of starting and stopping smokingexternal icon. EBioMedicine 2018; 37:214-220

3.Chandran A, Antony C, Jose L, et al., Mycobacterium Tuberculosis Infection Induces HDAC1-Medicated Suppression of IL-12B Gene Expression in Macrophagesexternal icon. Front Cell Infect Microbiol 2015; 5:90.

4.Tang Q, Cheng J, Cao X, et al., Blood-based DNA methylation as biomarker for breast cancer: a systematic reviewexternal icon. Clin Epigenetics 2016; 8: 115.

5.Johnson D, Barclay R, Mergener K, et al., Plasma Septin9 Versus Fecal Immunochemical Testing for Colorectal Cancer Screening: A Prospective Multicenter Studyexternal icon. PLoS One 2014; 9:e98238.

6.Food and Drug Administration. Epi proColonpdf iconexternal icon. 2016 [accessed 29 June 2020].

7.Roseboom T., Epidemiological evidence for the developmental origins of health and disease: effects of prenatal undernutrition in humansexternal icon. J Endocrinol 2019. 242:T135-T144

8.Heijmans B, Tobi E, Stein A, et al., Persistent epigenetic differences associated with prenatal exposure to famine in humansexternal icon. Proc Natl Acad Sci U S A 2008; 105: 17046-17049.

9.Tobi E, Lumey L, Talens R, et al., DNA Methylation Differences After Exposure to Prenatal Famine Are Common and Timing- And Sex- Specificexternal icon. Hum Mol Genet 2009; 18:4046-53.

10.Tobi E, Slieker R, Luijk R, et al., DNA methylation as a mediator of the association between prenatal adversity and risk factors for metabolic disease in adulthoodexternal icon. Sci Adv 2018; 4:eaao4364.

11.Dayeh T, Tuomi T, Almgren P, et al., DNA Methylation of Loci Within ABCG1 and PHOSPHO1 in Blood DNA is Associated With Future Type 2 Diabetes Riskexternal icon. Epigenetics 2016; 7: 482-8.

12.Pidsley R, Dempster E, Troakes C, et al., Epigenetic and genetic variation at the IGF2/H19 imprinting control region on 11p15.5 is associated with cerebellum weightexternal icon. Epigenetics 2012; 7:155-163.

Cayman Chemical表观遗传学相关产品介绍

Cayman Chemical表观遗传学相关产品介绍

甲基化及去甲基化检测试剂盒

DNA甲基化(methylation), 即将一个甲基基团转移到DNA上的化学过程, 是基因转录抑制或基因沉默的主要方式。DNA甲基化修饰特异的发生于CpG位点。甲基基团的插入改变了DNA的外形和结构, 可能会直接阻止DNA的识别和转录因子的结合, 或者吸引其他转录因子优先与DNA结合而干扰转录因子的可接近性。目前已经鉴定出三个可与甲基化DNA结合的蛋白家族, 包括MBD结构域蛋白、Kaiso及Kaiso样蛋白、SRA结构域蛋白。DNA甲基化标记通过募集这些蛋白, 可促进某些组蛋白状态的维持, 如去乙酰化。而组蛋白甲基转移酶催化组蛋白甲基化, 而去甲基化则由组蛋白去甲基化酶完成。Cayman开发出了一些列甲基化及去甲基化检测工具。

货号 产品名称 规格
700390 Demethylase (Jumonji-type) Activity Assay Kit 96 wells
700400 Demethylase (LSD-type) Activity Assay Kit 96 wells
589324 DNA Methylation EIA Kit

96 wells

or 480 wells

600570 GLP SAM-ScreenerTM Assay Kit

384 wells

or 1920 wells

700360 JMJD2A Inhibitor Screening Assay Kit 96 wells
700370 JMJD2D Inhibitor Screening Assay Kit 96 wells
700120 LSD1 Inhibitor Screening Assay Kit 96 wells
700140 Methyltransferase Colorimetric Assay Kit 96 wells
700150 Methyltransferase Fluorometric Assay Kit 96 wells
600580 MLL1 SAM-ScreenerTM Assay Kit

384 wells

or 1920 wells

700270

SET7/9 Methyltransferase Inhibitor Screening Assay Kit

96 wells
600490

SET7/9 SAM-ScreenerTM Assay Kit

384 wells

or 1920 wells

700350

SET8 Methyltransferase Inhibitor Screening Assay kit

96 wells

注:可复制货号或产品名称在本站搜索,即可查看该产品的更多详细信息)


乙酰化及去乙酰化检测试剂

乙酰化是指将一个乙酰基(CH3CO)增加到有机化合物上。组蛋白乙酰基转移酶(Histone acetyltranferases, HATs)催化乙酰基从乙酰辅酶A(CoA)转移到赖氨酸残基侧链的末端胺上。由于许多HATs也乙酰化其他蛋白的赖氨酸(缩写为’K’), 因此多数HATs也被命名为KATs。虽然大约20种的人HATs都有一个共同的酶催化能力, 一些HATs还作用于相同的组蛋白靶点, 但实际上HATs的功能是不同的。重要的是, 大多数HATs除含有乙酰基转移酶结构域外, 还含有不同的结合结构域。例如, MYST酶具有一个C2HC型锌指结构域, 可结合其他分子; 而CBP和P300具有溴结构域, 可结合乙酰化赖氨酸残基。这意味着每个HATs都具有某种特异性, 不论是结合位点还是乙酰化位点。带正电荷的赖氨酸转换为不带电荷的乙酰化赖氨酸, 犹如磷酸化过程中带负电荷的磷酸基转移到不带电荷的氨基酸一样, 改变蛋白的结构以及与其他生物分子的相互作用。例如组蛋白乙酰化通常促进效应分子的募集, 染色质构象的松弛以及活化转录等。

货号 产品名称 规格
10006515 HAT Inhibitor Screening Assay Kit 96 wells
10011563 HDAC Fluorometric Activity Assay Kit 96 wells
600150 HDAC Cell-Based Activity Assay Kit 96 wells
10011564 HDAC1 Inhibitor Screening Assay Kit 96 wells
700230 HDAC8 Inhibitor Screening Assay Kit 96 wells
10010401 SIRT1 Direct Fluorometric Screening Assay Kit 96 wells
10010991 SIRT1 FRET-Based Screening Assay Kit 96 wells
700280 SIRT2 Direct Fluorometric Screening Assay Kit 96 wells
10011566 SIRT3 Direct Fluorometric Screening Assay Kit 96 wells
700290 SIRT6 Direct Fluorometric Screening Assay Kit 96 wells

溴结构域TR-FRET分析试剂盒/Bromodomain TR-FRET Assay Kits

可用于高通量快速鉴定溴结构域/乙酰化肽相互作用的抑制剂。

货号 产品名称 规格
600710 BAZ2BbromodomainTR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600500 BRD2bromodomain1TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600510 BRD2bromodomain2TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600810 BRD2bromodomains1and2TR-FRET Assay Kit 384/1920 wells
600630 BRD3bromodomain1TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600820 BRD3bromodomains1and2TR-FRET Assay Kit 384/1920 wells
600640 BRD3bromodomain2TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600520 BRD4bromodomain1TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600530 BRD4bromodomain2TR-FRETAssayKit 384/1920 wells
600830 BRD4bromodomains1and2TR-FRET Assay Kit 384/1920 wells
600650 BRDTbromodomain1TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600720 BRG1bromodomainTR-FRET Assay Kit 384/1920 wells
600730 BRMbromodomainTR-FRET Assay Kit 384/1920 wells
600850 CBPbromodomainTR-FRET Assay Kit 384/1920 wells
600870 TAF-1bromodomain1TR-FRETAssay Kit 384/1920 wells
600930 TAF-1bromodomains1and2TR-FRET Assay Kit 384/1920 wells


关于Cayman Chemical:


Cayman以帮助全球从事人类健康以及动物健康研究事业的科学家提供研究工具为使命, 承诺为广大科研人员提供优质的产品和实惠的价格政策。公司拥有众多从事化学合成、纯化、生化分子的鉴定等领域的科学家。同时 , 在免疫检测、抗体生产、蛋白表达、蛋白结晶和测定等方面也具有丰富的研发和生产经验。在过去的30多年里, Cayman积淀了深厚的脂质化学知识, 包括涉及花生四烯酸级联、磷酸肌醇以及大-麻素等相关领域, 这些知识使得Cayman能够生产出品质卓越的试剂, 用于癌症、氧化损伤、表观遗传学、神经科学、炎症、代谢等领域的研究。目前, Cayman可提供生化试剂, 抗体, EIA检测试剂盒, 蛋白等多种产品。

Cayman提供的检测试剂盒非常丰富, 包括检测生物活性物质的ELISA试剂盒、基于活细胞的检测试剂盒、评估酶调节因子的筛选试剂盒等, 而且覆盖众多研究领域, 如血管发生、细胞凋亡、线粒体功能异常、毒理学等。

更多Cayman产品详情请咨询代理商-上海金畔生物

Genetex助力表观遗传学研究

Genetex助力表观遗传学研究

Genetex助力表观遗传学研究

表观遗传学是对影响基因活性和表达的可遗传表型变化的研究,这些变化不涉及 DNA 序列的改变,目前,DNA 甲基化是研究最广泛和表征最充分的表观遗传修饰之一,其他主要修饰包括染色质重塑、组蛋白修饰和非编码 RNA 机制,表观遗传修饰在发育、分化和疾病进展中发挥重要作用,例如各种癌症、智力低下相关疾病、免疫疾病、神经精神疾病和儿科疾病。

Genetex在助力表观遗传学主要体现在两个方面,1是组蛋白修饰,2是DNA甲基化。

组蛋白修饰:

Genetex助力表观遗传学研究

核小体核心颗粒是真核基因组的基本结构单元,它由一个组蛋白八聚体组成,该八聚体由两个 H2A-H2B 二聚体和一个 H3-H4 四聚体组成,由 ~146 个 DNA 碱基对包裹,接合组蛋白(即 H1)与核小体二元组以及核小体两侧的接合 DNA 结合,从而形成染色体,所有核心和接合组蛋白都经过翻译后修饰,总共进行了至少 160 次修饰,例如乙酰化、甲基化和磷酸化,这些修饰被认为通过改变染色质包装或通过招募/抑制特定染色质结合因子来影响染色质功能,请参阅下面热门的抗体或单击按钮查找所有相关产品。

热门研究产品:

供应商 产品名称 货号 规格
Genetex Histone H2A.XS139ph (phospho Ser139)抗体 GTX127340 25 μl/100 μl
Genetex Histone H3K27me3 (Tri-methyl Lys27)抗体 GTX121184 25 μl/100 μl
Genetex SMYD3抗体 GTX121945 25 μl/100 μl

DNA甲基化:

三种哺乳动物 5-甲基胞嘧啶 (5-mC) 双加氧酶(人类中是Ten Eleven Translocation (TET): TET1、TET2 和 TET3)将 5-mC 转化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5-hmC),然后转化为 5-甲酰胞嘧啶 (5 -fC) 和 5-羧基胞嘧啶 (5-caC),这一系列修饰被认为代表了活化DNA 去甲基化的一种途径,从而重塑了由 DNA 甲基转移酶 (DNMTs) 建立的甲基化 DNA 景观,此外,这些标记,尤其是 5-hmC,已被证明是影响干细胞和癌细胞生物学的独特表观遗传特征。

GeneTex 引入了一系列针对与 DNA 甲基化和去甲基化相关的靶标的抗体,其中许多抗体都适用于 ChIP/(h)MeDIP 应用。

热门研究产品:

供应商 产品名称 货号 规格
Genetex TDG抗体 GTX110473 25 μl/100 μl
Genetex DNMT1抗体 [N1], N-term GTX116011 25 μl/100 μl
Genetex TET2抗体 [N2-2], N-term GTX124205 25 μl/100 μl
Genetex DNMT3B抗体 GTX129127 25 μl/100 μl
Genetex SIN3A抗体 GTX129156 25 μl/100 μl
Genetex TET1抗体 [GT1462] GTX627420 100 μl

更多详情请咨询Genetex代理商-上海金畔生物

ENZO Life Sciences提供全面的表观遗传学研究工具!

ENZO Life Sciences提供全面的表观遗传学研究工具!

活性酶&药物筛选
自ENZO 第一个商业化Fluor de Lys® HDAC & Sirtuin 药物筛选试剂盒诞生至今的十多年间,Enzo 产品一直被国际期刊文献所广泛引用;
 
小分子化学&化合物库
Enzo 既可提供针对表观信号通路的独特化合物库,同时也可提供其他化合物库,如酶抑制剂,蛋白酶抑制剂等;
 
高品质抗体
Enzo 为表观遗传翻译后修饰研究提供超过3000 个单克隆及多克隆抗体。
 
点击表观遗传学产品手册下载产品详细信息。
 
Chemilum de lys HDAC/SIRT 化学发光法药物筛选试剂盒
 
化学发光检测法优势
◆ 特异性高,排除假阳性和假阴性结果
◆ 较高的信噪比,无细胞提取去污剂的干扰
◆ 经验证的检测体系保证实验数据的一致性
 
点击Chemilum de lys HDAC/SIRT 化学发光法药物筛选试剂盒 下载产品详细信息。