8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(Fpg)(也称:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶) #M0240L 2,500 units-NEB酶试剂 New England Biolabs

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8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(Fpg)(也称:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                                    #M0240L 2,500 units 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(Fpg)(也称:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                                    #M0240L 2,500 units 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(Fpg)(也称:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                                    #M0240L 2,500 units 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(Fpg)(也称:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                                    #M0240L 2,500 units 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(Fpg)(也称:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                                    #M0240L 2,500 units

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特性

·单细胞凝胶电泳(彗星试验)
·碱性析出
·碱解旋 

概述

8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖酶(Fpg),曾被称为:8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶
 
Fpg(甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA 糖基化酶)也称作 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶,既有 N-端糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-端糖基化酶活性可以切下双链 DNA 上受损的嘌呤碱基,产生一个脱嘌呤(AP)位点。AP-裂解酶活性可以切割 AP 位点的 3´ 或 5´ 端,因此可以除去 AP 位点,产生一个具有 3´ 和 5´ 磷酸的碱基缺口。
被 Fpg 识别并切除的受损碱基包括:7,8-二羟基-8-氧代鸟嘌呤(8-氧代鸟嘌呤)、8-羟基腺嘌呤、fapy-鸟嘌呤、甲基-fapy-鸟嘌呤、fapy-腺嘌呤、黄曲霉毒素 B1-fapy-鸟嘌呤、5-羟基-胞嘧啶和 5-羟基尿嘧啶。 

来源

克隆有 fpg 基因的重组 E. coli 菌株。 

反应条件

1X NEBuffer 1
[10 mM Bis Tris 丙烷-HCl,10 mM MgCl2 ,1mM DTT(pH 7.0 @ 25℃)] 加入 100 μg/ml BSA,37℃ 温育。
热失活:60℃ 加热 10 分钟。

质保声明

8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶经过严格的质控检测,确保该产品具有最高的活性和纯度。详情登陆  

单位定义

1 单位指在 10 μl 反应体系中,37℃条件下, 1 小时内能够切割 10 pmol 含单个与胞嘧啶配对的 8-氧代鸟嘌呤的 34 bp 寡核苷酸双链所需要的酶量。单位活性检测条件请联系我们。  

彗星试验的推荐稀释倍数

1:103~1:104。详细步骤见  

浓度

8,000 units/ml。 

参考文献

关于该酶性质和产品应用的参考文献,请联系我们。  

(-)-丁香树脂酚-4-O-β-D-呋喃芹糖基-(1→2)-β-D-吡喃葡萄糖苷 标准品

(-)-丁香树脂酚-4-O-β-D-呋喃芹糖基-(1→2)-β-D-吡喃葡萄糖苷 标准品

货号:
YZ-111911

品牌:
中检所

(-)-丁香树脂酚-4-O-β-D-呋喃芹糖基-(1→2)-β-D-吡喃葡萄糖苷 标准品

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产品简介
英文名称 (-)-Syringaresnol-4-O-β-D-apiofuranosyl-(1→2)-β-D-glucopyranoside
CAS 136997-64-3
分子式 C33H44O17
分子量 712.7
储存条件 -20℃
规格 20mg

热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(OGG)(也称:热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶) #M0464S 500 units-NEB酶试剂 New England Biolabs

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#M0464S
500 units
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产品特性

热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(OGG)(也称:热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                               #M0464S 500 units

·        热稳定型氧代鸟嘌呤糖

·        DNA 酶具有两种酶活:DNA N-酶活性和 AP 裂解酶活性

·        N-酶活性释放 8-oxo-7,8-二氢鸟嘌呤 (8-oxoG),生成 AP 位点。AP 裂解酶活性3′ 切割到 AP 位点,留下 5′ 磷酸和 3′-磷酸β-不饱和醛。

 

产品概述

 热稳定 OGG 是一种来源于古细菌的 8-氧代鸟嘌呤(8-oxoGDNA 酶,具有 N-酶活性和 AP-裂解酶活性。N-酶活性可从双链 DNA 中切割受损的 8-氧代鸟嘌呤,从而产生脱嘌呤 (AP) 位点。AP 裂解酶活性将 3′ 切割到 AP 位点,留下 5′ 磷酸和 3′-磷酸β-不饱和醛。与其它 DNA 酶不同的是,热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(OGG)仅特异性识别和切割 8-oxoG,对其它修饰的碱基没有活性。

1:与 8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(Fpg)不同,热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(OGG)特异性识别和切割 8-氧代鸟嘌呤,对其它修饰的碱基没有活性。

 热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基酶(OGG)(也称:热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶)                               #M0464S 500 units

使用热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(OGG8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(Fpg分别切割含有修饰碱基的荧光标记 dsDNA,以检测其切除修饰碱基的活性,修饰碱基类型为:8-氧代腺嘌呤、5-羟基胞嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基尿苷或 8-氧代鸟嘌呤。样品孵育后使用毛细管电泳检测,出峰位置体现裂解产物长度。结果显示:热稳定 8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(OGG仅裂解含 8-氧代鸟嘌呤的底物(上图),而 8-氧代鸟嘌呤 DNA 酶(Fpg对于含其它修饰碱基的底物也有活性,包括 5-羟基胞嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇和 5-羟基尿苷(下图)。

尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(也称:尿嘧啶-DNA 糖基化酶) #M0280L 5,000 units-NEB酶试剂 New England Biolabs

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尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(也称:尿嘧啶-DNA 糖基化酶)                              收藏

尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(也称:尿嘧啶-DNA 糖基化酶)                                   #M0280L 5,000 units 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(也称:尿嘧啶-DNA 糖基化酶)                                   #M0280L 5,000 units 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(也称:尿嘧啶-DNA 糖基化酶)                                   #M0280L 5,000 units 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(也称:尿嘧啶-DNA 糖基化酶)                                   #M0280L 5,000 units

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相关产品

尿嘧啶糖基化酶抑制剂(UGI)
 

特性

 去除 PCR 残存污染
 去除单链或双链 DNA 尿嘧啶碱基
 

概述

尿嘧啶-DNA 糖酶(UDG),曾被称为:尿嘧啶-DNA 糖基化酶
 
E. coli 尿嘧啶-DNA 糖基化酶(UDG)催化从含尿嘧啶的 DNA 上释放尿嘧啶。UDG 能有效地水解单链或双链 DNA 上的尿嘧啶,但不能从 6 碱基或更少的寡核苷酸上水解尿嘧啶。 

来源

克隆有 E. coli UDG 基因的重组 E. coli 菌株。 

应用

在 37℃ 条件下,1 单位 UDG 与 0.1 μg 含尿嘧啶 DNA 温育 10 分钟后,此 DNA 不能再被 DNA 聚合酶复制。95℃ 加热 10 分钟可使该酶 95% 的活性丧失。由于 95℃ 热处理后该酶仍有部分活性,建议加入尿嘧啶糖基化酶抑制剂来阻止产物 DNA 的降解,也可以立即用酚/氯仿抽提反应产物。 

反应条件

1X UDG 反应缓冲液
[20 mM Tris-HCl,1 mM EDTA,1 mM DTT(pH 8.0 @ 25℃)],37℃ 温育。 

质保声明

尿嘧啶-DNA 糖基化酶经过严格的质控检测,确保该产品具有最高的活性和纯度。详情请联系我们。  

单位定义

1 单位指每分钟催化 60 pmol 尿嘧啶从含尿嘧啶的双链 DNA 上释放所需要的酶量。通过检测 37℃ 条件下,30 分钟从 50 μl 含 0.2 μg DNA(104~105 cpm/μg)的反应体系中释放 [3H]-尿嘧啶的量来确定活性。单位活性检测条件请联系我们。  

浓度

5,000 units/ml。 

注意事项

UDG 在较广的 pH 范围均内有活性,最适 pH 为 8.0,不需要二价阳离子。活性受高离子强度(> 200 mM)所抑制。 

参考文献

关于该酶性质和产品应用的参考文献,请联系我们。  

尿嘧啶糖基酶抑制剂(UGI)(也称:尿嘧啶糖基化酶抑制剂) #M0281L 1,000 units-NEB酶试剂 New England Biolabs

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尿嘧啶糖基酶抑制剂(UGI)(也称:尿嘧啶糖基化酶抑制剂)                              收藏

尿嘧啶糖基酶抑制剂(UGI)(也称:尿嘧啶糖基化酶抑制剂)                                   #M0281L 1,000 units 尿嘧啶糖基酶抑制剂(UGI)(也称:尿嘧啶糖基化酶抑制剂)                                   #M0281L 1,000 units 尿嘧啶糖基酶抑制剂(UGI)(也称:尿嘧啶糖基化酶抑制剂)                                   #M0281L 1,000 units 尿嘧啶糖基酶抑制剂(UGI)(也称:尿嘧啶糖基化酶抑制剂)                                   #M0281L 1,000 units

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3,699.00

#M0281S
200 units
909.00

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描述

尿嘧啶糖酶抑制剂(UGI),曾被称为:尿嘧啶糖基化酶抑制剂

尿嘧啶糖基化酶抑制剂(UGI),来源于枯草芽孢杆菌噬菌体(Bacillus subtilis bacteriophage PBS1),蛋白分子量较小(9.5 kDa),可抑制大肠杆菌尿嘧啶 – DNA 糖基化酶(UDG)以及来源于其它物种的 UDGUDG UGI 11 比例进行可逆蛋白结合,发挥对 UDG 的抑制作用。UGI 可解离 UDG DNA 的复合物。

浓度

 2,000 units/ml

特点

·尿嘧啶糖基化酶抑制剂(UGI)蛋白分子量较小(9.5 kDa),可抑制大肠杆菌尿嘧啶 – DNA 糖基化酶(UDG)以及来源于其它物种的 UDG

·95℃ 热处理后该酶仍有部分活性。

·可用于阻止产物 DNA 的后续降解。

来源

 由携带有克隆自枯草芽孢杆菌噬菌体(Bacillus subtilis bacteriophage PBS1UGI 基因的大肠杆菌菌株表达纯化得来。

单位定义

 1 单位 UGI 指在 50 µl 反应体系中,37 条件下,1 小时抑制 1 单位大肠杆菌 UDG 酶所需的酶量。1 单位 UDG 是指每分钟从含尿嘧啶的双链 DNA 上催化解离 60 pmol 的尿嘧啶所需要的酶量。

反应条件

 1X UDG 反应缓冲液,37℃ 温育。

热失活

 不能热失活。

注意事项

 1由于 95 热处理后, UDG 酶仍有部分活性,建议加入尿嘧啶糖基化酶抑制剂(UGI)来阻止产物 DNA 的降解。

2、对 NEB 的大肠杆菌 UDG 酶有效(NEB #M0280)。

3、在原始反应中加入与 UDG 等量或者过量的 UGI

4、在四种 NEBuffer 中都有活性(NEB #B7001, NEB #B7002, NEB #B7003, NEB #B7004

5UGI 的热稳定性极高,煮沸 10 分钟仍具有 95% 以上的活性。

参考文献

 Lindahl,T.et al.(1977).J. Biol.Chem..252,3286-3294.

Wang,Z.,et al.(1991).Gene.99,31-37.

Bennett,S.E.and Mosbaugh,D.W.(1992).J.Biol.Chem..267,22512-22521.

WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG) #M1282S 200 units-NEB酶试剂 New England Biolabs

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WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                              收藏

WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units

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200 units
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产品特点

 WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units

·   闪烁古生球菌(Archaeoglobus fulgidus)尿嘧啶-DNA 糖基酶

·   该酶为耐热单功能 DNA 糖基酶,从含尿嘧啶的 DNA 上催化释放尿嘧啶,能有效地水解双链和单 DNA 上的尿嘧啶

·   WarmStart 技术抑制酶在42°C以下的活性,可用于在等温扩增反应后消除产物污染

·   从双链或单链 DNA 上切下尿嘧啶

概述

WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)来源于闪烁古生球菌(Archaeoglobus fulgidus),配方中加入了能够可逆结合的适配体,在低于 42℃ 条件下抑制酶活性。在 42℃ 以上具有活性,能有效地水解双链和单链 DNA 上的尿嘧啶。

产品描述

 图1.  WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)在低于 42℃ 的温度下未检测到活性。

 WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units

(A)Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(NEB #M0279)和WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(NEB #M1282)的 UDG 酶活性温度曲线比较,结果显示 WarmStart在42ºC以下抑制 UDG 酶活性。在25-65ºC 的温度梯度下,分别用0.002 U Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)或WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG),与1.8 pmol 含有单个尿嘧啶且带有荧光标记的 47-mer 单链DNA孵育30分钟。尿嘧啶被水解后,生成的碱基缺失片段经碱裂解(1M NaOH, 85°C 10分钟)处理,再通过Applied Biosystems 3730xl Genetic Analyzer ( 96 capillary array ) 进行电泳分析。结果显示,在 65°C 时 WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)与Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)活性相当,但在 25°C  时未检测到酶活性。 

(B) 在 30-45ºC 温度范围通过链置换反应技术(SDA),对 500bp 长度 λDNA
进行含有 dUTP 的扩增反应,分别在有 WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(上图)、 Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)(中图)和无 UDG(下图)的情况下进行。在没有 UDG的情况下(下图),SDA 在整个温度范围内均产生了 500 bp 的扩增条带。在含有 Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)的反应中(中图),高于 31℃ 的温度时,SDA 反应被Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)完全抑制。抑制的产生是由于Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)在低温下的固有活性,将扩增子中的尿嘧啶水解产生碱基缺失位点,从而阻止其进一步扩增。然而,在 WarmStart Afu Uracil-DNA 糖基酶(UDG)存在时(上图),除了在 45℃ 左右的产物产量略有下降外,对其他温度条件下扩增几乎没有影响,这表明 WarmStart Afu Uracil-DNA 糖基酶(UDG)在 42℃ 以上才具有活性。
 
图2.  WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)在 65℃ 有效地消化含尿嘧啶的扩增产物。
 
WarmStart® Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶 (UDG)                                     #M1282S 200 units
 
(A)使用 WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)在 SDA 反应扩增后消除产物污染示意图。在不含 UDG 或者含有 WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)情况下,对 500bp 片段进行SDA 等温扩增,反应中含有 dUTP 底物,反应温度 34℃,在此温度下 WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)不发挥活性。SDA 反应后,将产物在 65℃ 孵育 20 分钟以消化产物中的尿嘧啶。含有碱基缺失的 DNA 链在碱性条件下 85ºC 孵育 10 分钟会被降解。

(B)在 65ºC 下处理 20 分钟后,不含UDG和含有 WarmStart Afu 尿嘧啶-DNA 糖基酶(UDG)样品的凝胶电泳结果显示,其 500 bp 扩增产物的产量相似。然后 85℃ 碱性条件下孵育 10 分钟,降解含有碱基缺失的 DNA 产物。经过处理,500 bp 的产物在不含 UDG 的反应中保持完整,而在含有 WarmStart Afu Uracil-DNA 糖基酶(UDG)的反应中变成较弱的条带或者弥散状产物。