修饰磷酸应用举例:SELEX适配体文库筛选

修饰磷酸应用举例:SELEX适配体文库筛选

作为全球领先的核酸修饰专家,TriLink 的修饰性核苷酸在用于药物研发的各种技术中也应用广泛,SELEX技术便是其中之一。


SELEX,即指数富集的配体系统进化技术(Systematic Evolution of Ligands by Exponential EnrichmentSELEX),是一项用于筛选核酸适配体(Aptamer)的技术。核酸适配体,是可与蛋白质、金属离子、小分子、多肽甚至整个细胞等目的靶标进行高亲和力和特异性结合的一段寡核苷酸序列(DNARNA)。


与抗体相比,极性带负电的核酸分子与蛋白结合时可以提供更多的氧原子,提供更多的电子对去产生更多的氢键,增加相互作用的键能,维持更稳定的结构;另外,核酸适配体与抗体相比具有分子量小,稳定性更好,易改造修饰,无免疫原性,制作周期短,可以通过人工合成等优势,免去了动物免疫、饲养、蛋白提取和纯化等一系列流程。因此,核酸适配体相比抗体,在生化分析,生物医疗,新药研发等方面都有更大的潜力。


SELEX流程:

1. 确定目的靶标。(目标分子可以是蛋白质,小分子或超分子结构,甚至细胞。)

2. 构建随机寡核苷酸(~1 x 10 15个寡核苷酸)文库。

3. 靶标与文库核酸共孵育

4. 去除未结合的核酸片段,而结合的那些片段进行扩增后,进行下一轮筛选

5. 通过该过程,将与靶标有高亲和力的寡核苷酸从数万亿的数量中筛选出来

6. 对最终筛选出的适配体进行分类,纯化、测序以及后期修饰。


适配体的后期修饰,可以使适配体更加稳定性,并巩固适配体与目的靶标的亲和力,且进行了荧光等功能团修饰的适配体还可以用于检测和固定目的靶标。Trilink2′-Fluoro-dCTP(目录号N-1008)和2′-Fluoro-dUTP(目录号N-1010就经常被用于适的修饰。这些修饰类型提高了适体的稳定性,使其对核酸内切酶降解的抵抗力增强。


由SELEX衍生的PhotoSELEX技术使用5--2′-脱氧尿苷-5′-三磷酸酯(Br-dU)(TriLink目录号N-2008)代替标准的胸苷。除了通过空间构象与目的靶标结合,修饰体的Br-dU残基和靶标的酪氨酸之间也存在共价键。Br-dU修饰的寡核苷酸暴露于辐射中,处于正确构象的寡核苷酸靶分子上的特定位点共价交联。该技术可以实现蛋白质的高通量检测


SELEX只是修饰核苷酸的众多应用之一。TriLink提供了可用于多种研究目的的修饰核苷酸。

更多详情请联系TriLink中国代理商——上海金畔生物

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酵母双杂交文库构建酶试剂盒Takara Clontech

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

酵母双杂交文库构建
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 630490 Make Your Own “Mate & Plate” Library System 5 Rxns ¥19,475
¥14606
酵母双杂交文库构建 酵母双杂交文库构建 酵母双杂交文库构建

*红字为促销价格,促销时间: 2024年3月1日-2024年4月30日

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    文库构建        
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    预制文库        
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    酵母双杂交文库构建       酵母双杂交文库构建
 
 
■ 制品说明
Mate & Plate的优点
如果不使用Clontech的预制Mate & Plate Libraries,构建和筛选一个传统的酵母双杂交文库是非常繁冗的。而使用预制文库,只需将MATα型文库菌株和转入诱饵基因构建体的MATa型酵母菌株共同过夜孵育,然后将接合后的菌液涂板于合适的选择培养基上即可,操作简便。Clontech提供多种组织特异的、均一化的通用文库,适用于绝大多数文库筛选。
需要自己的文库吗?您可以自己制作,简便而且快速。
如果Mate & Plate Libraries中没有适合您需要的文库,您可使用Make Your Own Mate & Plate Library System自己制作文库。利用该系统,一周之内即可构建足够用于数百次酵母双杂交筛选实验的所需文库。文库构建是在Y187文库酵母菌株中通过酵母高效的同源重组机制直接完成的 (图1),无需传统文库构建过程中的一些繁冗的操作 (比如文库克隆、扩增和大肠杆菌收集等)。
酵母双杂交文库构建
 
经济有效的操作以及SMART技术
该系统利用Clontech的SMART cDNA合成技术,使用任意组织来源的少至100ng的总RNA,即可构建cDNA文库。SMART技术利用了MMLV (Moloney murine leukemia virus) RT的末端转移酶活性和模板转换机制,合成的一链cDNA序列末端含有已知的通用引物结合位点。因此,SMART一链cDNA可以通过PCR进行扩增,然后与具有末端同源序列的Matchmaker Gold 猎物载体pGADT7-Rec进行重组。基于以上特征,使用纳克级的RNA (例如来源于显微解剖组织、激光捕获细胞或者活检样品) 即可合成cDNA,共转化这些cDNA和pGADT7-Rec到酵母菌株Y187中,即可直接构建文库。
酵母双杂交文库构建
 
■ 制品特点
1. 利用SMART技术在酵母中直接构建文库
2. 无需繁琐的克隆或文库扩增
3. 足够用于数百次的双杂交筛选
 
产品详情请点击:酵母双杂交文库构建
 
 

页面更新:2023-02-14 14:27:04

酵母双杂交文库载体酶试剂盒Takara Clontech

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酵母双杂交文库载体
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 630442 pGADT7 AD Vector 20 μg ¥5,946 酵母双杂交文库载体 酵母双杂交文库载体 酵母双杂交文库载体
Clontech 630443 pGBKT7 DNA-BD Vector 20 μg ¥5,946 酵母双杂交文库载体 酵母双杂交文库载体 酵母双杂交文库载体
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Code No. 产品名称
630442   pGADT7 AD Vector
630443   pGBKT7 DNA-BD Vector
 
■ 制品说明
酵母双杂交载体
pGBKT7是酵母双杂交bait表达载体,旨在表达GAL4 DNA结合结构域(DNA-BD, 1-147 aa)与bait蛋白质的融合蛋白质。融合蛋白质在ADH1启动子下高水平表达,同时融合蛋白质含有一个c-Myc表位标签。为了促进体外转录和翻译,在pGBKT7的GAL4 DNA-BD和表位标签之间添加了T7启动子 。
· pGADT7 ——酵母双杂交 Prey 载体
pGADT7是酵母双杂交表达载体,旨在表达GAL4激活结构域(AD, 768-881 aa)与目的蛋白质的融合蛋白质。融合蛋白质在全长ADH1启动子下高水平表达,同时融合蛋白质含有一个血凝素(HA)表位标签。为了促进体外转录和翻译,在pGADT7的GAL4 AD和表位标签之间添加了T7启动子(1,2)。
 
■ 制品特点
1. 非常受欢迎并被广泛使用的酵母双杂交载体。
2. pGBKT7和pGADT7是Matchmaker Gold Yeast Two-Hybrid System的组分。
 
■ 制品用途
酵母双杂交筛选
 
■ 文献
1. Tirode, F. et al. (1997) J. Biol. Chem272:22995–22999.
2. Brachmann, R. & Boeke, J. (1997) Curr. Opin. Biotechnol8:561–568.
 
 
产品详情请点击:酵母双杂交文库载体
 
 

页面更新:2024-02-04 16:27:07

NGS文库定量酶试剂盒Takara Clontech

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NGS文库定量
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech 638325 DNA Standards for Library Quantification 50 Rxns ¥2,859 NGS文库定量 NGS文库定量 NGS文库定量
Clontech 638324 Library Quantification Kit 500 Rxns ¥7,288 NGS文库定量 NGS文库定量 NGS文库定量
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NGS文库定量 延伸 NGS文库定量 NGS文库定量 NGS文库定量
 
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高性能的文库定量试剂盒
Library Quantification Kit
· 可以对Illumina测序文库进行高灵敏度定量
· 基于qPCR的方法,可以对低浓度的文库进行定量
· 只特异性检出含有接头的DNA
· 添加了四种已知浓度的标准样品
 
产品详情请点击:NGS文库定量
 
 
 

页面更新:2020-09-16 09:25:20