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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
适用于以下细胞类型的文库制备：
癌症研究：循环肿瘤细胞（CTC）,激光捕获显微切割（LCM）细胞或DNA，
以及细针抽吸（FNA）细胞；
生殖健康研究：胚胎细胞和循环胎儿细胞；
发育生物学：胚胎细胞，干细胞和稀有细胞；
宏基因组学和微生物学：微生物细胞，微生物组和环境样品。
Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
品牌：Rubicon Genomics
货号：R300669
规格：24Rxns
Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
单细胞起始的DNA测序文库构建
SMARTer® PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit
· 高重现性和准确性：可用于CNV、SNV和非整倍体检测
· 在SNV和CNV检测方面优于MDA技术
· 三小时的工作流程，手动操作时间不到30分钟
· 均匀的高覆盖率，低的等位基因插入率和脱扣率
应用：
适用于以下细胞类型的文库制备：
· 癌症研究：循环肿瘤细胞（CTC）,激光捕获显微切割（LCM）细胞或DNA，
以及细针抽吸（FNA）细胞；
· 生殖健康研究：胚胎细胞和循环胎儿细胞；
· 发育生物学：胚胎细胞，干细胞和稀有细胞；
· 宏基因组学和微生物学：微生物细胞，微生物组和环境样品。
| 产品说明： | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一种旨在从单细胞中生成高质量的DNA文库，以便在Illumina平台进行测序的试剂盒。该试剂盒基于PicoPLEX技术，优化用于检测拷贝数变异 (CNVs)、单核苷酸变异 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和结构变异 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV检测中表现出比MDA技术更好的性能。 SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要单独购买。 PicoPLEX WGA是一种在全球被广泛用于检测单细胞中CNV的全基因组扩增（WGA）技术。最初，PicoPLEX技术主要用于高再现性的检测非整倍体异倍性和CNV。为了满足准确检测SNV的需求，对PicoPLEX WGA技术中的酶、引物和protocols进行了进一步优化，不仅提升了扩增的覆盖度、一致性、准确性，同时提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重现性。 SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定细胞或非固定细胞起始，只需简单的4步操作流程，即可在3小时内完成Illumina NGS文库的构建，且手动操作时间非常短。 |
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SMARTer DNA HT dual index kits |
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| SMARTer DNA HT dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列对应的index引物，最多可提供384种不同的双端index，用于样本混合测序时的区分。其中index引物预先分装在4个的不同条形码标记的index微孔板中，每个微孔板可提供不同的96种index组合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每个孔提供的量足够进行一次测序反应；另一种是一套中有24个单独的反应管，每个反应管中包含不同的双端index组合（Code No.R400664），且每个反应管（24N）提供的量足够进行两次测序反应。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SMARTer DNA unique dual index kits |
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| SMARTer DNA unique dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含“IDT for Illumina UD”对应的index引物，最多可提供96种不同双端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的4组各24个单独的管中，其中每组可提供24种不同index引物组合（Code No.R400665-R400668）。每个index引物管（24U Sets A-D）提供的量足够进行两次测序反应。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SMARTer DNA single index kits |
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| SMARTer DNA single index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含与“TruSeq LT set A”序列对应的index引物，可提供24种单端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的2组各12个单独的管中，其中每组可提供12种不同index引物组合（Code No.R400695和R400697）。每个index引物管（12U Sets A-B）提供的量足够进行8次测序反应。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 图1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技术。 PicoPLEX Gold的技术概要。通过step1裂解细胞获得gDNA，通过随机引物进行预扩增 (step 2)，然后进行指数扩增得到测序文库（step 4）。 |
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| 图2. PicoPLEX Gold的主要特点：高覆盖度，高均匀性，和高重现性 (与A产品技术相比)。 Panel A. 图中显示在不同深度的测序中覆盖的碱基数 (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在较低深度的覆盖度与A产品 (MDA) 相似，在较高深度的覆盖度高于A产品（MDA）。 Panel B. 以gDNA样本 (NA12878) 和单细胞样本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A产品进行全基因组扩增。相比较于MDA，PicoPLEX Gold显示出更均匀的覆盖度。 Panel C. 评估覆盖度的重现性。与A产品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在两个单细胞群之间的一致性明显更好。 |
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图3. 使用PicoPLEX Gold进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测。
Rubicon拥有ThruPLEX®和PicoPLEX®技术。特殊的引物或接头设计，能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。 ThruPLEX DNA-seq Kit 更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平台 更高的通量–多达 96 个 index 微量起始样品（50 pg – 50 ng），更高性能 快速简单的实验方法：一根管或孔中，仅三步反应，约 2 小时时间，无需转移 适用于所有主要的靶向富集平台–安捷伦 SureSelect® Enrichment，罗氏 NimbleGen® SeqCap EZ®，IDT xGEN® LockDown® probes ThruPLEX Plasma-seq Kit 专为血浆游离DNA设计 专为cfDNA设计：修复及连接试剂配方更新，方法优化 高品质NGS文库：在宽广的GC含量范围内，可以达到高检测再现性 起始量范围广：＜1 ng到30 ng cfDNA量 快速简便：单管、2小时、3步操作步骤，无需纯化或样品转移步骤 应用领域：液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建 兼容自动化平台：Beckman® FXP Workstation Takara&Clontech NGS系列产品
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